甲基橙是一种有机染料，通常在医学、生物学和化学实验中用于染色和指示剂。在碱性条件下，甲基橙的结构式为C14H14N3NaO3S。

它的分子结构包含一个苯环、一个萘环和一个三氮杂环。萘环上有两个甲基和一个苯环上的酰基。三氮杂环上有一个带负电荷的钠离子和一个甲基基团。

在碱性条件下，钠离子与甲基橙分子中的酸性氢离子（H+）结合，形成盐基化物。这种化学反应使甲基橙的颜色从黄色变为橙色，因此它被称为甲基橙。

甲基橙在实验室中广泛应用于酸碱指示剂、生物染色和药物筛选等领域。它不仅具有良好的染色性能，还具有良好的荧光性能，因此被广泛用于荧光显微镜下观察生物细胞和组织的结构。

总的来说，甲基橙在碱性条件下的结构式为C14H14N3NaO3S，具有广泛的应用价值和研究意义。