甲氧基苯甲醛和对硝基苯甲醛都是有机化合物，它们的结构中均含有苯环和甲醛基团。这两种化合物在化学性质上有所不同。

首先，甲氧基苯甲醛的分子中含有一个甲氧基基团，而对硝基苯甲醛的分子中含有一个硝基基团。这两种基团的化学性质不同，因此导致了它们的物化性质和应用方面的差异。

其次，甲氧基苯甲醛在化学反应中比对硝基苯甲醛更加容易发生亲电取代反应。这是由于甲氧基基团的电子效应比硝基基团更加弱，因此更容易被亲电试剂攻击。而对硝基苯甲醛则更容易发生亲核取代反应，这是由于硝基基团的电子效应比甲氧基基团更加强，因此更容易被亲核试剂攻击。

甲氧基苯甲醛和对硝基苯甲醛在应用上也有所不同。甲氧基苯甲醛常用于有机合成中，作为一种重要的中间体，用于制备其他有机化合物。而对硝基苯甲醛则常用于制备染料、药物等化学品，同时也是一种重要的炸药原料。

综上所述，尽管甲氧基苯甲醛和对硝基苯甲醛的结构相似，但它们的化学性质和应用方面存在着差异。对于化学研究和工业应用而言，了解这些差异对于正确选择化合物、控制反应条件和提高化学产品的质量具有重要意义。