甲基睾丸素和甲基睾酮是两种类似的化合物，它们都属于雄激素的一种。然而，它们在结构和功能上存在一些不同。

首先，甲基睾丸素是睾丸素的衍生物，而甲基睾酮则是睾酮的衍生物。甲基睾丸素和甲基睾酮的分子量分别为288.4和304.5，因此它们在分子大小上也存在一些差异。

其次，甲基睾丸素和甲基睾酮在人体内的作用也有所不同。甲基睾丸素主要作用于前列腺和生殖器官，可以促进前列腺的发育和维护正常的生殖系统功能。而甲基睾酮则在更广泛的范围内发挥作用，影响肌肉生长、骨骼密度、红细胞生成和性功能等多个方面。

此外，甲基睾丸素和甲基睾酮在药物治疗上也有不同的用途。甲基睾丸素常被用于治疗前列腺癌、乳腺癌和子宫内膜癌等激素依赖性疾病。而甲基睾酮则常被用于补充男性雄激素，以治疗男性不育、性功能障碍和低睾酮血症等疾病。

总的来说，甲基睾丸素和甲基睾酮虽然在结构和功能上存在一些不同，但它们在人体内都是重要的雄激素，对于维护男性生殖系统的正常功能和男性健康都具有重要意义。