1-甲基环己烯和3-甲基环己烯是两种常见的环烯烃化合物，它们的分子结构非常相似，唯一的区别在于甲基基团的位置。

在化学反应中，稳定性是一个非常关键的因素，因为它直接影响反应的速率和产物的生成。对于1-甲基环己烯和3-甲基环己烯来说，它们的稳定性有着一定的差异。

首先，1-甲基环己烯相对于3-甲基环己烯来说，具有更高的反应活性。这是因为1-甲基环己烯的甲基基团处于双键的一侧，可以更容易地与其他分子进行反应。而3-甲基环己烯的甲基基团则处于双键的对侧，反应难度更大。

其次，1-甲基环己烯的共轭体系比3-甲基环己烯更大，因此它的稳定性更低。共轭体系是指环烯烃分子中的双键和单键交替排列的结构，可以减少分子内部的电子排斥力，从而提高分子的稳定性。而1-甲基环己烯的共轭体系比3-甲基环己烯更长，因此分子内部的电子排斥力更大，稳定性更低。

综上所述，尽管1-甲基环己烯和3-甲基环己烯在分子结构上非常相似，但它们的稳定性却存在一定的差异。这些差异直接影响了它们在化学反应中的表现，需要我们在实际应用中加以注意。