亚甲基蓝是一种常用的生物染料，其分子大小是非常微小的。据研究表明，亚甲基蓝分子的分子量约为319.85克/摩尔，其分子直径大约在1纳米左右。

亚甲基蓝的分子大小对其在生物学研究中的应用有着重要的影响。由于其分子大小较小，因此可以很容易地穿过生物膜进入细胞内部，进而与细胞内的分子进行反应。同时，由于亚甲基蓝的分子大小较小，因此在染色过程中可以更好地渗透到细胞内部，从而更加均匀地染色。

除了在生物学研究中的应用，亚甲基蓝的分子大小也对其在医学上的应用有着影响。亚甲基蓝可以用于治疗一些与血液有关的疾病，如甲状腺功能亢进、骨髓增生异常综合症等。其分子大小的小巧使得其可以更好地穿过血液脑屏障，从而更好地起到治疗作用。

综上所述，亚甲基蓝的分子大小是其在生物学和医学中应用的重要因素之一。其小巧的分子大小使得其可以更好地渗透细胞和穿过血液脑屏障，从而在染色和治疗方面都具有很高的应用价值。